浮士托·佐那罗出生在奥地利帝国帕多瓦省的马西。他是泥瓦匠莫里佐与妻子伊莎贝塔·博顿的长子。莫里佐期望他的儿子也能成为一个泥瓦匠，然而在小时候，浮士托就展现出了绘画天赋。在父母的支持下，他起先进入了伦迪纳拉技术学院，随后又去了维罗纳美术学院，师从拿破仑·纳尼。浮士托在威尼斯开了一所艺术学校，他也经常去那不勒斯旅行。这一阶段他还没有找到自己的人生方向。
 

浮士托·佐那罗经常在展览中展出作品，因此也得到了评论家的尊重。他主要用油画或者水彩的形式来绘制风俗画。1883年在米兰，他展出了《那不勒斯的风景》《圣埃尔默》《平西欧山》；在罗马展出了《经过拉瓦卡》《痛苦》《那不勒斯的订书机》《萨波纳罗》。1884年在都灵展出了《暴风雨》《Primo nato》《Primo tuono》以及《那不勒斯的佐卡拉罗》；1887年在威尼斯展出了《期待》《Al Redentoretto》以及《Lavoratrice di perle》。

佐那罗的绘画生涯在1891年发生了转折，这年他爱上了自己在威尼斯的学生伊莎贝塔·潘特，并且他们一起去奥斯曼帝国的首都伊斯坦布尔旅行。他们被东方学者埃德蒙多·德·阿米琪斯的旅行书《君士坦丁堡》所激发灵感。1892年那罗与潘特结婚，并住在佩拉附近的伊斯坦布尔。
 

在伊斯坦布尔，随着时间的推移，佐那罗得到了贵族圈的赞助。议会部长穆尼尔·帕夏邀请他参观了伊迪茲宫，并将他介绍给当地一位颇有声望的艺术家奥斯曼·哈姆迪·贝。他被委任教帕夏的妻子绘画，通过这种方式，佐那罗和潘特了解了许多伊斯坦布尔同时代的重要艺术家，1896年他被任命为宫廷画家，感谢俄国大使向苏丹国王阿卜杜拉哈米德二世展示佐那罗的作品《图格鲁尔加拉塔桥上的帝国军团》，这件作品后来被阿卜杜拉哈米德二世购买。苏丹后来委托佐那罗绘制一系列表现15世纪奥斯曼苏丹哈默德二世的生平的作品。作为一位宫廷画家，佐那罗将自己视为威尼斯画家金泰·博里尼的继任者，他300年前被哈默德委任绘制他的肖像。

在伊斯坦布尔期间，浮士托·佐那罗目睹了默哈兰姆月第十日穆斯林什叶派举办的阿舒拉节游行，这个游行是Tatbir 的一部分，此活动激发了他的创作《默哈兰姆月第十日》，据报道，佐那罗说“在亲眼目睹了这一恐怖的活动，我希望我可以见到那位人们所哀悼的人。”佐那罗所暗示的“人”即是被压迫的穆斯林的先知穆罕默德的孙子侯赛因·伊本·阿里。
 

佐那罗在伊斯坦布尔一直待到1909年，他回到意大利后，土耳其革命推翻了他的赞助人阿卜杜拉哈米德二世的统治，并且建立了君主立宪制。在他之后再也没有了奥斯曼宫廷画家。最后他定居在圣雷莫，在那里他继续画小幅的作品主要描绘意大利的里维埃拉和附近法国的里维埃拉景色，直到他去世。
 

1920年浮士托·佐那罗离开了妻子与他的女儿住在一起。九年后他去世了。他被埋在圣雷莫的福斯公墓。在他的墓碑上，有一个奥斯曼图案，表明佐那罗是奥斯曼帝国的宫廷画家。